Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms