Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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