Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POP4O95707 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POP4O95707 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms