Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms