Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPLO60437 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPLO60437 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPLO60437 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms