Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCO2O43819 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCO2O43819 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCO2O43819 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCO2O43819 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCO2O43819 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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