Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms