Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TO15178 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TO15178 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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