Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD2O00469 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms