Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PCH4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PCH4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PCH4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PCH4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PCH4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PCH4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms