Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms