Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms