Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms