Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms