Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXND1Q9Y4D7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms