Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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