Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHMP3Q9Y3E7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHMP3Q9Y3E7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms