Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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