Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms