Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF7Q9UBF6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF7Q9UBF6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF7Q9UBF6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF7Q9UBF6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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