Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms