Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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