Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MIS18AQ9NYP9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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