Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNK4Q9NYG8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNK4Q9NYG8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms