Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms