Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms