Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms