Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-5Q9HDB9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms