Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B0

UNK, RING finger protein unkempt homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UNKQ9C0B0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UNKQ9C0B0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms