Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms