Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms