Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms