Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG2BQ96BY7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms