Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCTD13Q8WZ19 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms