Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms