Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms