Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms