Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME9Q86XW9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME9Q86XW9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME9Q86XW9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms