Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms