Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUPD1Q68J44 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms