Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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