Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LACTB2Q53H82 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms