Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms