Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A52Q3SY17 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms