Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISXQ2M1V0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms