Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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