Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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