Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms