Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SS18Q15532 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms