Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms